変異体に反映されているCovid-19ウイルスの宿主内変異、研究結果
ニューデリー：感染者のSARS-CoV-2ウイルスのゲノムに発生する変化は、感染の広がりと感染力を予測する上で「非常に有用」であると研究者が述べている研究によると、人口レベルで変化として反映されます。ウイルスCovid株の。
個人や集団の宿主内のウイルスに起こる変化を追跡することは、Covid-19を引き起こすSARS-CoV-2の生存に有利または不利なウイルス部位への重要なリードを提供するかもしれないと研究者らは述べた。
最近の研究の背後にあるチームには、国立疾病管理センターとデリーのCSIR-ゲノム統合生物学研究所（CSIR-IGIB）、およびブバネシュワールの生命科学研究所、科学革新アカデミーの研究者が含まれていました。ガーズィヤーバード、ハイデラバードの細胞および分子生物学のためのCSIRセンター（CSIR-CCMB）、およびインド工科大学、ジョドプールでの研究。
ウイルス学者のUpasanaRayは、この研究の結果に反応して、ウイルス変異体の出現は宿主での繁殖の成功に依存していると説明しました。
「突然変異は、ウイルスのライフサイクルで非常に一般的な現象です。 ウイルスが複製を受けて宿主細胞内で増殖する間、小さなヌクレオチドの変化が起こります」とコルカタのCSIR-インド化学生物学研究所の上級科学者であるレイはPTIに語った。
「ウイルスがますます伝染するにつれて、その宿主内でそのような変化を蓄積する機会がたくさんあり、その結果、亜種が出現します」と、研究に関与していなかったレイは言いました。
7月27日にプレプリントリポジトリBioRxivに投稿されたまだ公開されていない研究では、研究者はパンデミックの2つの異なる期間からのCovid-19診断患者のサンプルを分析しました。
研究のフェーズ1では、チームは2020年6月までに中国、ドイツ、マレーシア、英国、米国、およびインドのさまざまな亜集団から収集された1,347のサンプルを分析し、SARSのゲノムワイドな宿主内一塩基多型（iSNV）マップを認識しました。 -CoV-2感染集団。
一塩基多型（SNV）は、ウイルスの遺伝物質の基本的な構成要素であるヌクレオチドの置換です。
Rayによると、iSNVはホスト内で発生するバリエーションです。 彼女は、これらの突然変異が最終的に集団レベルで反映されるかもしれないし、反映されないかもしれないと付け加えた。
「宿主内SNVが生き残るためには、そのような変異体は増殖して広がり、それゆえにそれ自体を確立することができなければならない」と科学者は述べた。
研究者らは、B.1およびB.6系統を定義したものを含め、ウイルスゲノムにまたがる18,146のiSNVサイトを観察しました。
英国で最初に同定されたアルファ変異体、南アフリカで最初に発見されたベータ変異体、およびインドから最初に報告されたデルタ変異体は、SARS-CoV-2のこの系統に属しています。
「興味深いことに、これらのサンプルで特定されたすべての一意のiSNVの41％が、GISAIDで提出された1つ以上のサンプルで2020年9月30日までにSNVとして報告され、2021年6月30日までに80％に増加しました」研究が指摘した。
GISAIDは、インフルエンザウイルスとCovid-19パンデミックの原因となっているコロナウイルスのゲノムデータへのオープンアクセスを提供する世界的な科学イニシアチブであり、主要な情報源です。
研究のフェーズ2では、著者は2020年11月から2021年5月の間にインドでシーケンスされた1,798のサンプルを分析しました。
彼らは、iSNVが時間の経過とともに集団のSNVに現れる可能性があるという証拠を発見しました。
「これらのサンプルでは、iSNVは、2021年2月までにSNVとして固定される前に、デルタ（B.1.617.2）およびカッパ（B.1.617.1）系統を定義するゲノム位置のほとんどの集団に存在することが記録されました。 」と研究者らは述べた。
「これらの結果は、ウイルス疫学のより正確なモデルを可能にするためのゲノム監視プログラムの拡張としてiSNVを記録することの重要性を強調しています」と彼らは言いました。
著者らはまた、スパイクタンパク質の87％の部位でiSNVを観察しました。これは、ウイルスがヒト細胞に侵入して感染するために使用し、最近抗体耐性を付与することが報告されています。
現在のワクチンは、SARS-COV-2ウイルスのスパイクタンパク質を対象としています。
「これらの変異は、免疫原性を変化させる可能性があるため、ワクチンの反応に大きな影響を与える可能性があります」と著者らは述べています。
免疫原性は、体内で免疫応答を引き起こすワクチンの能力です。
「この研究は、このウイルスの生存に有利または不利な残基に関する重要な洞察を明らかにし、したがって、これらの変異しやすいタンパク質を標的とする次世代の治療法を設計するのに役立つ可能性があります」とレイは付け加えました。
